物理处理

崇仁污水处理采用物理处理的方法。污水先通过格栅去除大颗粒物质。随后进入沉淀池，稍事停留，污泥沉淀至池底。接着，经过去油池处理，去除浮油。这样处理后的污水，除去一部分悬浮颗粒物、沉淀物和浮油，仍然含有大量溶解性有机和无机污染物，需要进一步处理。

生物处理

生物处理是崇仁污水处理的核心部分。将物理处理后的污水导入生物反应器，通过微生物将有机物质转化为无机物质，这样处理的污水达到排放标准。崇仁污水处理采用的生物处理方式为曝气式生物处理，曝气可以加强生物反应器内氧化还原体系的氧化过程，使污水中的可生化有机物质更快被微生物分解。

消毒处理

经过物理处理和生物处理的污水，在通过消毒处理器中进行杀菌。一方面，可以去除残留病菌、致病微生物和寄生虫卵，从而达到消毒消疫的目的，更好的保障水环境安全。另一方面， 消毒防止了在污水流入全市自来水管网后，造成水龙头头部等处附着菌斑的情况， 保障市民出水安全 。这就是实现崇仁污水整治的目的之一。